Table of Contents:

Autumn Semester 秋季学期

Advanced Courses  博士生课程

I. Bioinformatics in Action《生物信息学实践》

本课程也设有少量的本科生容量，同时也和春季学期的本科生课《生物信息学》的很多内容相同，本学期没有选上的本科同学也可以下学期选修这门本科生课。

主讲课程

【Teaching Philosophy】

“Study and Practice” 格物致知 | 知行合一

We teach professional skills in bioinformatics. These skills are not just running software. They will give you freedom of exploring various real data.

【课程简介】

相对于过去，突然地，我们发现数据不是太少而是太多，信息不是匮乏而是繁杂，新一代人的重要能力是“鉴别”和“挖掘”。我们将教授生物信息学方面的专业技能， 这些技能不是单纯地运行软件的能力，而是让你们拥有探索各种真实数据的自由。

生物信息学是采用数学、统计学、计算机等方法分析生物医学数据的一种交叉性学科。

该课程的教学目的是为了让学生对生物信息的基础知识有所了解和掌握，同时让学生能够掌握实用的生物信息学实用技能和编程技术。课程设计是让学生逐步学习生物信息基础知识和练习基础计算机技能，能够对常用的生物信息学技术有所掌握。课程将让学生从了解和练习基本的Linux操作开始，通过生物信息必备的计算语言（如Bash, R, Python等）的编程训练，掌握生物信息学在新一代高通量测序数据上的基本分析方法。

该课程除了理论教学，加强补充了实践练习的训练环节，更强调学生对生物信息学实际应用的实践学习和上机练习，在往年基础上加大了课程的挑战性和实用性。

【预修课程准备】

  1. 基本生物课程： 如《普通生物学》
  2. 基本统计课程： 如《概率论》和/或《生物统计》
  3. 基本数学课程： 如《线性代数》
  4. 基本计算机技能：如 Linux基础 + C或Python语言

II. Introduction to Genomics - PTN 《基因组学导论-PTN》

PTN基础课 – 8hr

PTN学生上课要求

教学资源

作业

文献阅读: (Due: Dec. 31.) Pick one of the papers (NOT the Reviews papers) and write a brief summary, including your discussion and perspectives (1-2 pages). Note: Please list the key points of your thoughts in the last paragraph.

Basic Courses 本科生课程

I. Frontier of Life Sciences 《生命科学前沿》

讲授单元：生物信息和基因组学介绍 – 2hr

【课程简介】

本课程重点介绍生命科学前沿领域生化、细胞、发育、遗传、免疫、化生、生物物理、系统生物学等的发展历史、现状、及展望，使学生对基本生命科学的概貌有较全面了解。本课程重在训练学生思维及逻辑，普及作为生命学科的本科生应该了解专业内容。

Spring Semester 春季学期

Advanced Courses  博士生课程

I. Bioinformatics and Systems Biology《生物信息学和系统生物学》

讲授单元：Models and Algorithms in Bioinformatics – 9hr

II. RNA Biology《RNA生物学》

讲授单元：RNA生物信息学 – 2hr

Basic Courses 本科生课程

I. Bioinformatics《生物信息学》

本课程课堂容量有限，但和秋季学期的研究生课《生物信息学实践》的很多内容相同，此研究生课也设有一定的本科生容量，本学期没有选上的同学可以下学期选修这门研究生课。

主讲课程

【Teaching Philosophy】

“Study and Practice” 格物致知 | 知行合一

We teach professional skills in bioinformatics. These skills are not just running software. They will give you freedom of exploring various real data.

【课程简介】

相对于过去，突然地，我们发现数据不是太少而是太多，信息不是匮乏而是繁杂，新一代人的重要能力是“鉴别”和“挖掘”。我们将教授生物信息学方面的专业技能， 这些技能不是单纯地运行软件的能力，而是让你们拥有探索各种真实数据的自由。

生物信息学是采用数学、统计学、计算机等方法分析生物医学数据的一种交叉性学科。

该课程的教学目的是为了让学生对生物信息的基础知识有所了解和掌握，同时让学生能够掌握实用的生物信息学实用技能和编程技术。课程设计是让学生逐步学习生物信息基础知识和练习基础计算机技能，能够对基本的生物信息学技术有所掌握。课程将让学生从了解和练习基本的Linux操作开始，通过生物信息必备的计算语言（如Bash, R, Python等）的编程训练，掌握生物信息学在新一代高通量测序数据上的基本分析方法。

该课程除了理论教学，加强补充了实践练习的训练环节，更强调学生对生物信息学实际应用的实践学习和上机练习，在往年基础上加大了课程的挑战性和实用性。

【预修课程准备】

  1. 基本生物课程： 如《普通生物学》
  2. 基本统计课程： 如《概率论》和/或《生物统计》
  3. 基本数学课程： 如《线性代数》
  4. 基本计算机技能：如 Linux基础 + C或Python语言

II. Biophysics 《生物物理学》

讲授单元：RNA Secondary Structure Prediction – 6hr

Other Courses 其他课程